Ладно при Советской власти проекты были плохие. Но и сейчас приходится удивляться, когда в новостройке люди все равно перестраивают заведомо неудобные планировки. И совсем не понятны ограничения с переносом не несущих стен и перегородок. Все, скорее всего, сделано длдя того чтобы армия всяких чиновников-бездельников была при работе.
Как по мне, архитектор спроектировавший дом и строительная компания построившая его могут согласовать или нет переделки. Если таковых уже нет, то специализованый, специально назначенный экспертный орган.
Все остальные просто прилепалы.
А БТИ - обычная контора, которая должна просто регистрировать не более того.